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微孔滤膜过滤就是通过机械作用过滤去液体或气体中细菌的方法。微孔滤膜过滤就是根据不同的需要选择用不同的滤器和滤板材料。微孔滤膜过滤器是由上下二个分别具有出口和入口连接装置的塑料盖盒组成，出口处可以连接针头，人口处可以连接针筒，使用的时候将滤膜装入两塑料盖盒之间，旋紧盖盒，当溶液从针筒注入滤器时，此滤器将各种微生物阻留在微孔滤膜上面，从而达到了除菌的目的。根据待除菌溶液量的多少，可以选用不同大小的滤器。这个方法除菌的最大优点就是可以不破坏溶液中各种物质的化学成分，但是由于滤量有限，所以一般只适用于实验室中小量溶液的过滤除菌。
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